إِذْ : ظرف لما مضى من الزمن متعلق بفعل محذوف تقديره اذكر
قالَ اللَّهُ : فعل ماض لفظ الجلالة فاعله والجملة في محل جر بالإضافة
يا عِيسى : يا أداة نداء وعيسى منادى مفرد علم مبني على الضمة المقدرة على ٫٫٫ الألف للتعذر
إِنِّي مُتَوَفِّيكَ : إن واسمها وخبرها والكاف في محل جر بالإضافة ، والجملة مقول القول٫
وَرافِعُكَ إِلَيَّ : عطف على متوفيك والجار والمجرور متعلقان برافعك
وَمُطَهِّرُكَ مِنَ الَّذِينَ كَفَرُوا : مطهرك عطف والجار والمجرور متعلقان بمطهرك وماض وفاعله وجملة كفروا صلة الموصول
وَجاعِلُ الَّذِينَ اتَّبَعُوكَ : جاعل عطف والذين اسم موصول في محل جر بالإضافة ، وماض وفاعله والجملة صلة٫
فَوْقَ : مفعول فيه ظرف مكان متعلق بالمفعول الثاني المحذوف
الَّذِينَ : في محل جر بالإضافة وجملة
كَفَرُوا : صلة
إِلى يَوْمِ : متعلقان باسم الفاعل جاعل
الْقِيامَةِ : مضاف إليه
ثُمَّ : حرف عطف
إِلَيَّ مَرْجِعُكُمْ : جار ومجرور متعلقان بمحذوف خبر مرجعكم مبتدأ٫
فَأَحْكُمُ بَيْنَكُمْ : الفاء عاطفة وفعل مضارع فاعله مستتر وبينكم ظرف متعلق بالفعل قبله
فِيما : متعلقان بأحكم
كُنْتُمْ : فعل ماض ناقص ، والتاء اسمها والجملة صلة الموصول لا محل لها
فِيهِ : متعلقان بالفعل بعدهما
تَخْتَلِفُونَ : فعل مضارع وفاعل والجملة في محل نصب خبر كنتم.